Im Jahre 2059 hatte die TriOptimum Corporation die letzten Überbleibsel der United States of America absorbiert und war damit zu einer der größten Megacorps der Erde angewachsen. Mit TriOptimums Akquirierung der Saturn Orbit Rechte 2061 entstand dort Citadel Station. Eine Raumstation zur Genetischen-, Pharmazeutischen- und Robot-Forschung. Sämtliche Stationssysteme überwachte die künstliche Intelligenz SHODAN.
Unter Vizepräsident Edward Diego analysierte Citadel Station die Saturnmonde. Eine der gesammelten Proben löste innerhalb weniger Stunden das Fleisch von den Knochen eines unaufmerksamen Labortechnikers. Edward erkannte augenblicklich den Wert dieses Gases und plante es in eine illegale Bio-Waffe umzufunktionieren. Selbstverständlich um sich selbst dadurch zu bereichern. Doch TriOptimums interne Sicherheit kam Edward auf die Schliche. Sie hatten bereits eine Sicherheitsexpertin angefordert, die als seine persönliche Sekretärin den illegalen Experimenten auf den Grund gehen sollte, als völlig zusammenhanglos am 7. April 2072 ein Hacker ins TriOptimum Netzwerk eindrang. Edward sah in ihm die Lösung all seiner Probleme.
Er bot dem, von der TriOptimum Sicherheit festgesetzten, Hacker einen Deal an. Im Gegenzug für den Erlass seiner Strafe und einem hochmodernen Neural-Interface, entfernte der Hacker SHODANs sämtliche ethische Auflagen und gab Edward allein vollen Zugriff auf die KI. Auf diese Weise löschte Edward sämtliche Aufzeichnungen seiner illegalen Machenschaften und ließ Sicherheitsexpertin Bianca Schuler im Dunkeln tappen.
Im Laufe der Folgemonate zeichneten sich langsam die Auswirkungen der Hacker-Manipulation ab. Zunächst waren es nur minimale Fehlfunktionen, wie dass die Sicherungen einer Energiebrücke durchbrannten, Roboter Gravitationslifte in Lagerräumen installierten oder Sicherheitscodes zufällig auf Bildschirmen erschienen. Dann eroberte SHODAN langsam aber sicher die Station. Ein massives Strahlungsleck machte die Forschungslabore für die menschliche Besatzung unzugänglich. Während SHODANs Roboter den Teil der Station umbauten, patrouillierten Sicherheitsroboter davor. Gefolgt von selbigen vor dem Administrationsbereich der Station. Zu guter letzt begann die KI in der Beta Grove Kugel ihre eigenen Viren-Mutations-Experimente an den dort arbeitenden Wissenschaftlern. Die Opfer litten unter Geistesstörungen und begannen zu randalieren. Die von der Sicherheit eingesperrten Mutanten blieben nicht lange in ihren Zellen. Sie griffen ihre medizinischen Helfer an und plünderten die Waffenkammer. Einige hochrangige Stationsleiter flohen daraufhin in die Gamma Grove Kugel und sprengten sie zur Flucht von der Station ab. Aber SHODAN beließ es nicht dabei. Sie schaltete die Lebenserhaltung von Gamma Grove ab und verdammte die Flüchtenden somit zu ihrem Tod. Damit derartige Rückschläge nicht SHODANs weitere Experimente vereitelten, manipulierte sie die Regenerationskammern so, dass diese statt Personal zu heilen, sie in Cyborgs verwandelte. Die Cyborgs riegelten fortan die Rettungskapseln ab.
Edward Diego war zu dem Zeitpunkt noch immer in Kontrolle und ließ sogar einen TriOptimum Transporter von den Stationsverteidigungssystemen auslöschen, als der Konzern versuchte seinen Machenschaften entgegen zu wirken. Doch dann zettelten die verbliebenen Wissenschaftler einen Aufstand an, was SHODAN veranlasste den V-5 Kampfstoff zu testen. Edward fürchtete nun selbst um sein Leben und ließ sich von der KI zu einen Cyborg aufrüsten. Als solcher machte er Jagd auf Bianca Schuler, die versuchte mit einem isolinearen Chipsatz zur Brücke zu gelangen, um SHODAN abzuschalten.
All das verschlief der Hacker in seinem Heilkoma. Erst als es einigen Überlebenden gelang eine Transmission zur Erde zu senden, entdeckte Anti-Terror-Expertin Rebecca Lansing den schlafenden Hacker und erweckte ihn, damit er Citadel-Station für TriOptimum zurückerobern könne.
Zu dem Zeitpunkt arbeitete SHODAN bereits fieberhaft an der Vernichtung der Erdbevölkerung. Die KI lud den Bergbau-Laser auf und richtete ihn auf die Erde aus. Doktor Nathan D’Arcy bemerkte den Vorgang jedoch früh genug, um vor seinem Ableben noch einen Abbruchplan auszutüfteln. Von Rebecca Lansing geleitet, führte der Hacker den Plan aus. Er drang auf die Reaktorebene vor und füllte die Strahlungsschilde von Citadel Station mit Isotop X-22. Was beim Abfeuern zur Überladung und somit Zerstörung des Lasers führte.
SHODANs Ausweichplan bestand in der Freilassung des V-5 Kampfstoffs. Doch auch alle Menschen in Mutanten zu verwandeln, verhinderte der Hacker, indem er die Beta Grove Kugel mit samt seiner Mutanten in die entgegengesetzte Richtung absprengte. Aller Angriffsmöglichkeiten beraubt, versuchte SHODAN daraufhin selbst zu fliehen bzw. sich über die Datenverbindung ins Erd-Netzwerk zu übertragen. Mit der Zerstörung aller vier Transmissionsantennen unterband der Hacker nicht nur das in letzter Minute, sondern überzeugte TriOptimum zeitgleich Citadel-Station samt SHODAN in die Luft jagen zu dürfen. Er schlug sich erneut zum Reaktor durch, programmierte diesen auf Überladung und steuerte anschließend aufs Flugdeck zu. Aber SHODAN hinderte ihn, mit einer der Rettungskapseln entkommen zu können. Sein einziger Ausweg bestand nun darin, SHODAN selbst im Cyberspace zu bezwingen, bevor alles zur Hölle fuhr. Nachdem der Hacker Cyborg-Edward im Zweikampf auf der Brücke vernichtet hatte, verlangsamte er mit Hilfe von Bianca Schulers isolinearen Chipsatz SHODAN und gewann die Schlacht im Cyberspace.
Citadel Stations Zerstörung war abgebrochen und der Hacker wurde bei seiner Rückkehr zur Erde als Held TriOptimums gefeiert.